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憑據膜組件和生物反響器的組合方法，可將膜--生物反響器分為分置式、一體式以及復合式三種根本范例。（以下討論的均為固液分散型膜--生物反響器）

MBR膜分置式

把膜組件和生物反響器離開設置。生物反響器中的混淆液經循環泵增壓后打至膜組件的過濾端，在壓力作用下混淆液中的液體透過膜，成為體系處置處罰水；固形物、大分子物質等則被膜扣留，隨濃縮液回流到生物反響器內。

分置式膜--生物反響器的特點是運行穩固可靠，易于膜的洗濯、調換及增設；并且膜通量廣泛較大。但一樣通常條件下為淘汰污染物在膜外貌的沉積，延伸膜的洗濯周期，必要用循環泵提供較高的膜面錯流流速，水流循環量大、動力用度高（Yamamoto,1989），并且泵的高速旋轉產生的剪切力會使某些微生物菌體產生失活征象（Brockmann and Seyfried,1997）。

MBR膜一體式

把膜組件置于生物反響器內部。進水進入膜--生物反響器，此中的大部門污染物被混淆液中的活性污泥去除，再在外壓作用下由膜過濾出水。

這種情勢的膜--生物反響器由于省去了混淆液循環體系，并且靠抽吸出水，能耗相對較低；占地較分置式更為緊湊，在水處置處罰范疇受到了分外存眷。但是一樣通常膜通量相對較低，容易產生膜污染，膜污染后不容易洗濯和調換。

MBR膜復合式

情勢上也屬于一體式膜--生物反響器，所差另外是在生物反響器內加裝填料，從而形成復合式膜--生物反響器，轉變了反響器的某些性狀。